中国卫生部通报，10月26日15时至10月28日15时，我国内地新增甲型H1N1流感确诊病例6345例，其中3例为境外输入性病例，6342例为境内感染病例。截至10月28日，我国内地31个省市自治区累计报告42009例甲型H1N1流感确诊病例，已治愈30854例。重症病例累计66例，已治愈22例，死亡4例。

28日晚，北京市卫生局通报：北航军训团发生甲流聚集性疫情，并出现1例甲流死亡病例。北京市卫生局10月28日公布，十月22日，北京航空航天大学3000余名2009级新生赴大兴高校军训基地开展军训期间，部分学生中陆续出现发热等流感样症状。10月26日，一名新生因病情发展送往区医院救治，经全力抢救无效，于27日死亡。北京市卫生、教育部门现已督促并协调北京航空航天大学进一步采取隔离、防控措施。其中，体温超过38摄氏度的71名学生已有28名咽拭子检测甲型H1N1流感病毒核酸阳性。目前，患者病情基本稳定，生命体征平稳，无危重病人。

　　 北京市委、市政府也成立了专门工作组，会同学校展开工作，部署有关部门全力救治患者、有效控制疫情、保持秩序稳定，落实“四方责任”，加强发热患者排查，严格执行疫情报告制度，任何单位和个人不得瞒报、漏报、迟报传染病疫情。针对一些市民的疑问，市卫生局局长方来英表示：医学上一直认为“感冒是百病之源”，此前每年的季节性流感，也会导致一些患者出现重症或死亡。只要措施得当，甲流是可防可控可治的，市民不必恐慌。

在10月26日举行的中华预防医学会第三届学术年会上，卫生部部长陈竺说，据我国流感监测系统最近报告，近期我国流感样病例所检测到的病原体中，甲型H1N1流感病毒已占72%。陈竺表示，由于有序的防控措施，我国甲型H1N1流感疫情一直处在有效的控制之下。目前，中国成为世界上最早完成了13000人的大规模疫苗接种试验，并于9月初成为世界上第一个甲型H1N1流感疫苗正式上市的国家。目前疫苗接种工作正在有序进行，预计到今年年底，将完成6500万人的疫苗接种。尽管如此，陈竺警示道，目前甲型H1N1流感病毒已在中国各地广泛扎根，当前我国的防控政策已由“外堵输入、内防扩散”调整为加强学校、社区防控，努力减少疫情危害。